输液泵是液相色谱仪系统中比较重要的部件之一，它主要作用是将流动相匀速注入液相色谱系统中，形成稳定的流路。泵的性能好坏会直接影响到分析过程速率以及分析结果的准确性。一般而言，输液泵应具备流量稳定、输出压力高、密封性好等性能。
泵的种类很多，按输液性质可分为恒压泵和恒流泵。恒流泵按结构又可分为螺旋注射泵、柱塞往复泵和隔膜往复泵。恒压泵受柱阻影响，流量不稳定；螺旋泵缸体太大，这两种泵已被淘汰。目前应用多的是柱塞往复泵。
柱塞往复泵的液缸容积小，因此易于清洗和更换流动相，特别适合于再循环和梯度洗脱；改变电机转速能方便地调节流量，流量不受柱阻影响。其主要缺点是输出的脉冲性较大，现多采用双泵系统来克服。
为了保证输液泵输液的稳定性，在使用液相色谱仪输液泵过程中应当注意问题如下：
①防止任何固体微粒进入泵体，因为尘埃或其它任何杂质微粒都会磨损柱塞、密封环、缸体和单向阀，因此应预先除去流动相中的固体微粒杂质。流动相的预处理方法是使用溶剂过滤器进行过滤除杂。除此之外，输液泵的滤器应经常清洗或更换。
②流动相不应含有任何腐蚀性物质，含有缓冲液的流动相不应保留在泵内，尤其是在停泵过夜或更长时间的情况下。如果将含缓冲液的流动相留在泵内，由于蒸发或泄漏，甚至只是由于溶液的静置，就可能析出盐的微细晶体，这些晶体将和上述固体微粒一样损坏密封环和柱塞等。因此，必须泵入纯水将泵充分清洗后，再换成适合于色谱柱保存和有利于泵维护的溶剂（对于反相键合硅胶固定相，可以是甲醇或甲醇-水）。
③泵工作时要留心防止溶剂瓶内的流动相被用完，否则空泵运转也会磨损柱塞、缸体或密封环，终产生漏液。
④输液泵的工作压力决不要超过规定的高压力，否则会使高压密封环变形，产生漏液。
⑤流动相应该先脱气，流动相脱气简单的方法是使用超声波清洗机进行超声波处理。气泡进入泵内，会使泵发生空转，磨损泵，并且会影响流量的稳定性。
